根据中共大同市委、大同市人民政府《关于印发大同市人民政府机构改革方案的通知》（同发〔2009〕23号），设立大同市卫生局，正处级建制，为市人民政府工作部门。
一、职责调整
（一）取消国务院、省及市人民政府已公布取消的行政审批事项。
（二）将食品卫生许可，餐饮业、食堂等消费环节食品安全监管和保健食品、化妆品卫生监督管理职责，划转市食品药品监管局。
（三）划入市食品药品监管局综合协调食品安全、组织查处食品安全重大事故的职责。
（四）划入市质量技术监督局食品生产企业标准备案职责。
（五）划入原市环卫局市爱国卫生委员会办公室的职责。
（六）划入市疾控中心承担的艾滋病防治委员会办公室的职责。
（七）增加组织制定食品安全地方标准、食品安全风险评估、食品安全信息公布的职责。
（八）增加贯彻执行国家药品法典，建立并组织实施国家基本药物制度的职责。
（九）加强食品安全综合监督职责。
（十）加强对医疗服务、公立医疗机构的监督管理。
（十一）加强重点传染病控制及地方病防治。加强新型农村合作医疗管理。
（十二）深化医药卫生体制改革，坚持公共医疗卫生的公益性质，坚持预防为主、以农村为重点、中西医并重的方针，坚持为人民健康服务的方向。
二、主要职责
（一）推进医药卫生体制改革。拟定全市卫生改革与发展战略目标、规划和方针政策；组织实施国家关于卫生、食品安全、药品、医疗器械的法律、法规和方针、政策；起草卫生、食品安全、药品、医疗器械相关地方性法规、规章草案和规范性文件并监督实施；依法拟定有关标准和技术规范。
（二）贯彻执行国家基本药物制度，组织实施药品法典和国家基本药物目录。拟定全市国家基本药物采购、配送、使用的政策措施，会同有关部门提出国家基本药物目录内药品生产的鼓励扶持政策，提出国家基本药物制度本市补充目录价格政策的建议。
（三）承担食品安全综合协调、组织查处食品安全重大事故的责任，组织实施国家和省食品安全标准，负责食品及相关产品的安全风险评估、预警工作，统一发布重大食品安全信息。
（四）统筹规划与协调全市卫生资源配置，指导区域卫生规划的编制和实施。
（五）组织拟定并实施农村卫生发展规划和政策措施，负责新型农村合作医疗的综合管理。
（六）拟定社区卫生、妇幼卫生发展规划和政策措施，规划并指导社区卫生服务体系建设，负责妇幼保健的综合管理和监督。
（七）负责疾病预防控制工作，拟定实施重大疾病防治规划与策略，拟定免疫规划及政策措施，协调有关部门对重大疾病实施防控与干预，发布法定报告传染病疫情信息。
（八）负责卫生应急工作，拟定卫生应急预案和政策措施，负责突发公共卫生事件监测预警和风险评估，指导实施突发公共卫生事件预防控制与应急处置，发布突发公共卫生事件应急处置信息。
（九）起草促进中医药事业发展的地方性法规、规章草案，拟定有关政策措施，拟定中医药中长期发展规划，并纳入卫生事业发展总体规划和战略目标。
（十）指导规范卫生行政执法工作，按照职责分工负责职业卫生、放射卫生、环境卫生和学校卫生的监督管理，负责公共场所和饮用水的卫生安全监督管理，负责传染病防治监督。
（十一）负责医疗机构（含中医机构等）医疗服务的全行业监督管理，拟定医疗机构医疗服务、技术、医疗质量和采供血机构管理的政策、规范、标准，组织制定医疗卫生职业道德规范，建立医疗机构医疗服务评价和监督体系。
（十二）组织拟定医药卫生科技发展规划，组织实施国家及省重点医药卫生科研攻关项目，参与拟定医学教育发展规划，组织开展继续医学教育和毕业后医学教育工作。
（十三）指导卫生人才队伍建设工作，组织拟定全市卫生人才发展规划，会同有关部门制定卫生专业技术人员资格标准并组织实施。
（十四）组织指导卫生方面的国际交流合作与卫生援外有关工作，开展与港澳台的卫生合作工作。
（十五）负责保健对象的医疗保健工作，负责市级部门有关干部医疗管理工作，负责省和市内重要会议与重大活动的医疗卫生保障工作。
（十六）承担市爱国卫生运动委员会、市防治艾滋病工作委员会的具体工作。
（十七）承办市人民政府交办的其他事项。
三、内设机构
根据上述职责，大同市卫生局设17个内设机构和离退休人员工作科、机关党委办公室、监察室。
